蛋白质功能预测Venus系列模型面世

内容摘要本报讯(见习记者江庆龄)3月22日,在上海交通大学举办的蛋白质功能预测Venus(启明星)系列模型发布暨产业合作峰会现场,上海交通大学教授洪亮发布了团队的最新成果,将有助于解决蛋白质设计改造的问题。洪亮介绍,团队建立的蛋白质序列数据集Ven

本报讯(见习记者江庆龄)3月22日,在上海交通大学举办的蛋白质功能预测Venus(启明星)系列模型发布暨产业合作峰会现场,上海交通大学教授洪亮发布了团队的最新成果,将有助于解决蛋白质设计改造的问题。

洪亮介绍,团队建立的蛋白质序列数据集Venus-Pod含有近90亿条蛋白质序列,包含数亿个功能标签,是全球数据规模最大、功能批注标签最多的数据集。“该数据集作为巨大的‘蛋白质矿藏’,可以从中挖掘出新的蛋白或者生物催化剂,助力生物医药和合成生物学的快速发展。”

同时,洪亮团队瞄准蛋白质“功能预测”这一终极目标,训练了Venus系列模型,其预测蛋白质突变功能的精度位居行业榜首。洪亮表示,Venus系列模型具备“AI定向进化”“AI挖酶”两大核心功能。

值得一提的是,团队配置了配合Venus系列模型的全球首款低通量大体积蛋白质表达、纯化与功能检测自动化一体机,可在24小时内不间断完成100余个蛋白质的表达、纯化与功能检测任务,较人力效率提高近10倍。在软件和硬件的双重加持下,经过Venus系列模型设计的多款蛋白质已经实现了产业化落地。

“我们的宗旨是‘设计AI化,实验自动化’,让科研人员从繁琐的设计和实验中解放出来,只需要提出问题,而由AI和自动化来解决问题,最终将复杂的蛋白质科学发现变成‘傻瓜相机式’的简单过程。”洪亮说。

 
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